Protein–RNA interactions for Protein: Q5TA76

LCE3A, Late cornified envelope protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCE3AQ5TA76 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
LCE3AQ5TA76 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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