Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HSD17B12Q53GQ0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HSD17B12Q53GQ0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms