Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC27Q2M243 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms