Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
DUSP6Q16828 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP6Q16828 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms