Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
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FOXD1Q16676 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 GPALPP1-203ENST00000379151 1393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
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FOXD1Q16676 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
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FOXD1Q16676 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
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FOXD1Q16676 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
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FOXD1Q16676 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
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FOXD1Q16676 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
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FOXD1Q16676 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
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FOXD1Q16676 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
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FOXD1Q16676 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
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FOXD1Q16676 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
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FOXD1Q16676 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXD1Q16676 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
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