Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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NRF1Q16656 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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NRF1Q16656 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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NRF1Q16656 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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NRF1Q16656 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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NRF1Q16656 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
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NRF1Q16656 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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NRF1Q16656 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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NRF1Q16656 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NRF1Q16656 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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