Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SGCBQ16585 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SGCBQ16585 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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