Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC85BQ15834 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC85BQ15834 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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