Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF1AQ15573 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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TAF1AQ15573 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TAF1AQ15573 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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