Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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RYR3Q15413 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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RYR3Q15413 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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RYR3Q15413 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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RYR3Q15413 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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RYR3Q15413 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RYR3Q15413 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RYR3Q15413 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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RYR3Q15413 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
RYR3Q15413 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
RYR3Q15413 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
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