Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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RABEP1Q15276 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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RABEP1Q15276 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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RABEP1Q15276 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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RABEP1Q15276 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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RABEP1Q15276 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RABEP1Q15276 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABEP1Q15276 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABEP1Q15276 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABEP1Q15276 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABEP1Q15276 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABEP1Q15276 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABEP1Q15276 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABEP1Q15276 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABEP1Q15276 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABEP1Q15276 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABEP1Q15276 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RABEP1Q15276 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
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