Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NKX1-1Q15270 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NKX1-1Q15270 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
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