Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HERPUD1Q15011 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERPUD1Q15011 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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