Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MDC1Q14676 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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