Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBE4AQ14139 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms