Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EIF4EBP1Q13541 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EIF4EBP1Q13541 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms