Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C1orf61Q13536 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms