Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRQ13535 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRQ13535 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRQ13535 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRQ13535 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRQ13535 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRQ13535 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRQ13535 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRQ13535 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATRQ13535 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRQ13535 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRQ13535 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRQ13535 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRQ13535 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRQ13535 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRQ13535 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRQ13535 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRQ13535 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRQ13535 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRQ13535 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRQ13535 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRQ13535 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRQ13535 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRQ13535 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRQ13535 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRQ13535 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRQ13535 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRQ13535 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRQ13535 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRQ13535 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRQ13535 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRQ13535 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRQ13535 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATRQ13535 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATRQ13535 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATRQ13535 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATRQ13535 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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