Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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