Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SMAD4Q13485 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMAD4Q13485 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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