Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXE3Q13461 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms