Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TCOF1Q13428 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCOF1Q13428 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
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