Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMS2P3Q13401 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms