Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
KLF1Q13351 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KLF1Q13351 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms