Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SGCGQ13326 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGCGQ13326 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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