Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME3Q13232 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME3Q13232 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME3Q13232 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME3Q13232 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NME3Q13232 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NME3Q13232 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NME3Q13232 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NME3Q13232 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NME3Q13232 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME3Q13232 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME3Q13232 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME3Q13232 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME3Q13232 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME3Q13232 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NME3Q13232 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME3Q13232 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME3Q13232 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME3Q13232 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME3Q13232 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME3Q13232 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME3Q13232 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME3Q13232 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME3Q13232 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NME3Q13232 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NME3Q13232 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME3Q13232 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NME3Q13232 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME3Q13232 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME3Q13232 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME3Q13232 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME3Q13232 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME3Q13232 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NME3Q13232 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME3Q13232 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME3Q13232 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME3Q13232 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME3Q13232 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME3Q13232 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME3Q13232 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME3Q13232 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME3Q13232 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME3Q13232 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NME3Q13232 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME3Q13232 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME3Q13232 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME3Q13232 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME3Q13232 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME3Q13232 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME3Q13232 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME3Q13232 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME3Q13232 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME3Q13232 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME3Q13232 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME3Q13232 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME3Q13232 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME3Q13232 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME3Q13232 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME3Q13232 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME3Q13232 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME3Q13232 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME3Q13232 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME3Q13232 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME3Q13232 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME3Q13232 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NME3Q13232 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME3Q13232 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME3Q13232 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME3Q13232 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME3Q13232 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME3Q13232 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME3Q13232 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME3Q13232 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME3Q13232 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME3Q13232 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME3Q13232 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME3Q13232 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME3Q13232 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME3Q13232 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME3Q13232 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME3Q13232 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME3Q13232 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NME3Q13232 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME3Q13232 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME3Q13232 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME3Q13232 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME3Q13232 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME3Q13232 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME3Q13232 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME3Q13232 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME3Q13232 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME3Q13232 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME3Q13232 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME3Q13232 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME3Q13232 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME3Q13232 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME3Q13232 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME3Q13232 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME3Q13232 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NME3Q13232 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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