Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DUSP4Q13115 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms