Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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TRAF3Q13114 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TRAF3Q13114 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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TRAF3Q13114 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TRAF3Q13114 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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