Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms