Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PTPRJQ12913 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PTPRJQ12913 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms