Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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FOXO1Q12778 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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FOXO1Q12778 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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FOXO1Q12778 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXO1Q12778 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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