Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RBBP4Q09028 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RBBP4Q09028 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms