Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDE4DQ08499 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDE4DQ08499 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms