Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms