Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SRSF11Q05519 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms