Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KCNC4Q03721 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KCNC4Q03721 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms