Protein–RNA interactions for Protein: Q02817

MUC2, Mucin-2, humanhuman

Predictions only

Length 5,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC2Q02817 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC2Q02817 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MUC2Q02817 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MUC2Q02817 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MUC2Q02817 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
MUC2Q02817 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MUC2Q02817 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MUC2Q02817 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MUC2Q02817 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
MUC2Q02817 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MUC2Q02817 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC2Q02817 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC2Q02817 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC2Q02817 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC2Q02817 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC2Q02817 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC2Q02817 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC2Q02817 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC2Q02817 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC2Q02817 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC2Q02817 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC2Q02817 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC2Q02817 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms