Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms