Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FANCCQ00597 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms