Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXC5Q00444 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms