Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GTF2BQ00403 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GTF2BQ00403 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms