Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VLDLRP98155 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
VLDLRP98155 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VLDLRP98155 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VLDLRP98155 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VLDLRP98155 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VLDLRP98155 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VLDLRP98155 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VLDLRP98155 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VLDLRP98155 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VLDLRP98155 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VLDLRP98155 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VLDLRP98155 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VLDLRP98155 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VLDLRP98155 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VLDLRP98155 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VLDLRP98155 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VLDLRP98155 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VLDLRP98155 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VLDLRP98155 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VLDLRP98155 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VLDLRP98155 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VLDLRP98155 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms