Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMF1P82094 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMF1P82094 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMF1P82094 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMF1P82094 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMF1P82094 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMF1P82094 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMF1P82094 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMF1P82094 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMF1P82094 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMF1P82094 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMF1P82094 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMF1P82094 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMF1P82094 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMF1P82094 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMF1P82094 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMF1P82094 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMF1P82094 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMF1P82094 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMF1P82094 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TMF1P82094 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMF1P82094 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TMF1P82094 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMF1P82094 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMF1P82094 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMF1P82094 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMF1P82094 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMF1P82094 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TMF1P82094 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMF1P82094 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMF1P82094 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TMF1P82094 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMF1P82094 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMF1P82094 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMF1P82094 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TMF1P82094 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMF1P82094 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMF1P82094 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMF1P82094 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMF1P82094 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMF1P82094 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TMF1P82094 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TMF1P82094 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMF1P82094 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMF1P82094 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TMF1P82094 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMF1P82094 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMF1P82094 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMF1P82094 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMF1P82094 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMF1P82094 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMF1P82094 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMF1P82094 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMF1P82094 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMF1P82094 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TMF1P82094 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMF1P82094 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMF1P82094 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMF1P82094 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMF1P82094 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMF1P82094 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMF1P82094 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMF1P82094 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMF1P82094 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMF1P82094 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMF1P82094 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMF1P82094 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMF1P82094 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMF1P82094 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TMF1P82094 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMF1P82094 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMF1P82094 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMF1P82094 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMF1P82094 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMF1P82094 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMF1P82094 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMF1P82094 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMF1P82094 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMF1P82094 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMF1P82094 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMF1P82094 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMF1P82094 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMF1P82094 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMF1P82094 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMF1P82094 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMF1P82094 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMF1P82094 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TMF1P82094 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMF1P82094 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMF1P82094 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMF1P82094 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMF1P82094 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMF1P82094 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMF1P82094 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMF1P82094 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMF1P82094 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMF1P82094 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMF1P82094 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMF1P82094 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TMF1P82094 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms