Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
SSBP2P81877 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SSBP2P81877 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms