Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTG2P63267 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG2P63267 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG2P63267 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG2P63267 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG2P63267 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG2P63267 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG2P63267 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG2P63267 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG2P63267 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG2P63267 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG2P63267 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG2P63267 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG2P63267 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG2P63267 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG2P63267 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG2P63267 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG2P63267 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG2P63267 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG2P63267 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG2P63267 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG2P63267 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTG2P63267 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms