Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SKP1P63208 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SKP1P63208 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP1P63208 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP1P63208 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP1P63208 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP1P63208 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP1P63208 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP1P63208 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP1P63208 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP1P63208 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP1P63208 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP1P63208 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP1P63208 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP1P63208 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP1P63208 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP1P63208 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP1P63208 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP1P63208 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP1P63208 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP1P63208 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP1P63208 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP1P63208 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP1P63208 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP1P63208 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP1P63208 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP1P63208 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SKP1P63208 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SKP1P63208 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP1P63208 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP1P63208 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP1P63208 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP1P63208 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP1P63208 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP1P63208 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP1P63208 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP1P63208 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP1P63208 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SKP1P63208 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms