Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBA52P62987 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBA52P62987 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBA52P62987 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBA52P62987 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms