Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ACTA2P62736 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ACTA2P62736 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms