Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
RPS29P62273 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
RPS29P62273 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
RPS29P62273 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS29P62273 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS29P62273 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS29P62273 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS29P62273 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS29P62273 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS29P62273 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS29P62273 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS29P62273 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS29P62273 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
RPS29P62273 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
RPS29P62273 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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