Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms